多年來醫學上的研究，發現人體中的細菌和人體的健康狀況有許多密切的關係，這其中的一個研究課題，就是經由自然生產，和經由剖腹生產的嬰兒，因為在最開始的時候，身體內原始的細菌殖民不同，就會影響接下來身體裡頭不同的細菌，影響身體健康狀態的發展。有若干初步的證據指出剖腹生產的嬰兒，比較容易染上敏感和哮喘。不過大概短則六個月，長則七歲，經由自然生產和剖腹生產的嬰兒，體內的細菌的聚落，就沒有什麼不同了。同時嬰兒也可以經由母乳，獲得幫助他健康成長的細菌。