就在初步調查結束後，媒體報導德雷福斯是叛徒。接著他在軍事法庭上被告叛國罪，但三份專家鑒定認為德雷福斯的筆跡與那張告密紙上的筆跡不同。此外，儘管著名人類學家和偵探學家阿爾封·貝蒂榮在辨認手跡方面沒有經驗，但是法官卻聽取了貝蒂榮的意見。貝蒂榮認為兩份筆跡相同的鑒定被作為判德雷福斯有罪的主要證據。 德雷福斯聲明自己無罪，但是無效。法國一致判處他有罪並判處他終身流放和關押到魔鬼島。他到達那裡並被單獨監禁。